La "Religión Mapuche", no es fácil de entender, ya que todo esta interconectado, entendiéndose esto como necesario para la supervivencia del Pueblo como tal. Se basa en términos generales en la ligación del Mundo espiritual Mapuche, que juega un rol muy importante y crucial, con el Mundo tangible, en el sentido de que conjuntamente sustentan de buena y correcta forma la vida en la tierra espiritual y la tierra material, ubicándose ambas en un mismo espacio y fusionadas. La creencia del pueblo Mapuche se basa principalmente en el respeto al mundo espiritual que es grandemente amplio, considerándose al Mapuche netamente espiritual y esta parte como necesaria obligadamente para el substento de la vida en la Tierra conjuntamente al mundo material, tangible o naturaleza; en el culto a los espíritus y antepasados, llamados Pillanes (espíritus o todo del tipo espiritual, de mayor o menor rango), Wangulén, Antu, etc, o estos en su naturaleza genérica Ngen. Actualmente por la Conquista de Chile y el Cristianismo, mecanismo que fue utilizado como otras para someter y erróneamente "civilizarlos", creen en un ser superior que los gobierna, llamado Ngenechén, que está formado principalmente por cuatro aspectos o personas, ya que éste antes de la Conquista de Chile, hacía parte de las cuatro formas que controlan, crean, corrigen y cuidan a: la naturaleza o Mapu, a los espíritus o pillû; lo que se traduce al español como pillán, y a las personas o Che respectivamente, encontramos entonces a quien crea a la naturaleza, a quien crea a los espíritus, a quien crea a las personas o Che, a quien controla a la naturaleza, a quien controla a los espíritus, etc.; de ahí Ngenechén, aquella parte del Ser Superior Mapuche que controla a las personas del Mundo Mapuche o Mapuche Wallmapu y de las que es dueño, véase Ngen; antes de la influencia cristiana en esta cultura, conformaban espíritus de cierta forma "individuales". A pesar del número de seres presentes en sus creencias, nunca erigieron un panteón de dioses propios, a la manera de los griegos o los germanos.
La figuras más importantes dentro de la religión son por excelencia el Machi, el Lonko y el Ngenpin, encargados del culto, el conocimiento y de la celebración de variados rituales, según el Territorio Mapuche; en el que destaca un ritual mezcla de adoración y diversión, llamado guillatún, según el territorio en dónde se celebre, siendo de carácter netamente religioso en la zona de precordillera y CordilleramismA; y el machitún, que es una ceremonia de sanación y augurio. En el pueblo Mapuche, no existen claros indicios donde se celebracen sacrificios humanos, y se cree actualmente que al haber ocurridos pudieron haber sido siempre como una manera de expiación frente a grandes cataclismos naturales (la última vez registrada, ocurrió después del terremoto de Valdivia de 1960, el más devastador en la historia de Chile).
La mitología mapuche se caracteriza por ser muy variada. Ejemplo de ello es la leyenda de la creación de la geografía de Chile; denominada la historia de Cai Cai y Tren Tren o Ten Ten. Además su mitología presenta numerosos seres mitologcos, tales como el Chonchón; y personajes semimíticos como el Calcu.
En relación a la religión cristiana y el pueblo mapuche, en noviembre de 2007 fue la beatificación del primer mapuche, el argentino "Ceferino Namuncurá".